MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP2

Total Repeats: 562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007352	TC	3	6	25	30	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007352	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007352	TAA	2	6	77	82	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007352	AT	3	6	109	114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007352	AGG	2	6	170	175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007352	A	6	6	199	204	100 %	0 %	0 %	0 %	73663803
7	NC_007352	GAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
8	NC_007352	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
9	NC_007352	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	73663803
10	NC_007352	AT	3	6	432	437	50 %	50 %	0 %	0 %	73663803
11	NC_007352	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
12	NC_007352	A	6	6	453	458	100 %	0 %	0 %	0 %	73663803
13	NC_007352	ATC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663803
14	NC_007352	GCA	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663803
15	NC_007352	ATG	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
16	NC_007352	AGT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
17	NC_007352	ATT	2	6	630	635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663803
18	NC_007352	A	7	7	655	661	100 %	0 %	0 %	0 %	73663803
19	NC_007352	TAG	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
20	NC_007352	AAG	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
21	NC_007352	ATA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
22	NC_007352	TCA	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007352	CTCC	2	8	787	794	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007352	T	6	6	860	865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007352	AGT	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007352	TA	3	6	911	916	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
27	NC_007352	TG	3	6	928	933	0 %	50 %	50 %	0 %	73663804
28	NC_007352	AGA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663804
29	NC_007352	TAA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
30	NC_007352	AATT	2	8	994	1001	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
31	NC_007352	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663804
32	NC_007352	TA	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
33	NC_007352	ATC	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663804
34	NC_007352	T	6	6	1057	1062	0 %	100 %	0 %	0 %	73663804
35	NC_007352	ATA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
36	NC_007352	TAAAT	2	10	1094	1103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007352	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007352	ATA	2	6	1160	1165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007352	CCG	2	6	1229	1234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007352	AAC	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007352	A	7	7	1272	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007352	ATA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007352	TAT	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007352	AAG	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007352	AATT	2	8	1401	1408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007352	TA	3	6	1448	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007352	TAACA	2	10	1458	1467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007352	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007352	T	6	6	1530	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007352	AATT	2	8	1541	1548	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
51	NC_007352	T	6	6	1573	1578	0 %	100 %	0 %	0 %	73663805
52	NC_007352	CAG	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663805
53	NC_007352	CT	3	6	1610	1615	0 %	50 %	0 %	50 %	73663805
54	NC_007352	TTC	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
55	NC_007352	ATC	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
56	NC_007352	TCT	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
57	NC_007352	TGT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663805
58	NC_007352	TTCTTG	2	12	1723	1734	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73663805
59	NC_007352	TTC	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
60	NC_007352	CTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
61	NC_007352	AAT	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663805
62	NC_007352	TCTT	2	8	1828	1835	0 %	75 %	0 %	25 %	73663805
63	NC_007352	TTA	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
64	NC_007352	TATT	2	8	1920	1927	25 %	75 %	0 %	0 %	73663805
65	NC_007352	TA	4	8	1956	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
66	NC_007352	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
67	NC_007352	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
68	NC_007352	CTT	3	9	2028	2036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
69	NC_007352	T	8	8	2035	2042	0 %	100 %	0 %	0 %	73663805
70	NC_007352	ATC	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
71	NC_007352	T	6	6	2072	2077	0 %	100 %	0 %	0 %	73663805
72	NC_007352	TAC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
73	NC_007352	T	6	6	2136	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	73663805
74	NC_007352	T	6	6	2158	2163	0 %	100 %	0 %	0 %	73663805
75	NC_007352	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
76	NC_007352	TA	3	6	2272	2277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007352	TAT	2	6	2280	2285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007352	TTA	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007352	TA	3	6	2327	2332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007352	TA	3	6	2349	2354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007352	TAT	2	6	2356	2361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007352	TA	3	6	2416	2421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007352	T	6	6	2480	2485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007352	TA	3	6	2507	2512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007352	TTA	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007352	AT	4	8	2549	2556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007352	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007352	TTTG	2	8	2611	2618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007352	TA	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007352	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007352	TA	3	6	2643	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007352	ATT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007352	ACTT	2	8	2685	2692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007352	TTA	2	6	2701	2706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007352	T	6	6	2804	2809	0 %	100 %	0 %	0 %	73663806
96	NC_007352	AAT	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
97	NC_007352	AT	3	6	2919	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
98	NC_007352	T	6	6	2924	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	73663806
99	NC_007352	TAG	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663806
100	NC_007352	A	6	6	2996	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	73663806
101	NC_007352	TCAA	2	8	3024	3031	50 %	25 %	0 %	25 %	73663806
102	NC_007352	TAAA	2	8	3045	3052	75 %	25 %	0 %	0 %	73663806
103	NC_007352	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
104	NC_007352	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
105	NC_007352	A	6	6	3071	3076	100 %	0 %	0 %	0 %	73663806
106	NC_007352	TATAT	2	10	3099	3108	40 %	60 %	0 %	0 %	73663806
107	NC_007352	CAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
108	NC_007352	TAA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
109	NC_007352	ATGATA	2	12	3177	3188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73663806
110	NC_007352	CAT	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
111	NC_007352	TA	3	6	3266	3271	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
112	NC_007352	AAT	2	6	3281	3286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
113	NC_007352	ATGA	2	8	3299	3306	50 %	25 %	25 %	0 %	73663806
114	NC_007352	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
115	NC_007352	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
116	NC_007352	TAA	2	6	3370	3375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
117	NC_007352	GAA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
118	NC_007352	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
119	NC_007352	GTAA	2	8	3431	3438	50 %	25 %	25 %	0 %	73663806
120	NC_007352	TAT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
121	NC_007352	GAA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
122	NC_007352	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
123	NC_007352	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
124	NC_007352	AGA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
125	NC_007352	TGC	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
126	NC_007352	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
127	NC_007352	CGT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
128	NC_007352	ACA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
129	NC_007352	AAT	2	6	3711	3716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
130	NC_007352	TCA	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007352	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007352	TGA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663807
133	NC_007352	ACA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663807
134	NC_007352	GAA	3	9	3954	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663807
135	NC_007352	ATT	2	6	4006	4011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663807
136	NC_007352	A	7	7	4016	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	73663807
137	NC_007352	T	6	6	4070	4075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007352	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007352	AAT	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007352	TATT	2	8	4113	4120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007352	TAA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007352	T	6	6	4148	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007352	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007352	T	6	6	4193	4198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007352	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007352	A	6	6	4297	4302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_007352	CAA	2	6	9984	9989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_007352	TA	3	6	10055	10060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007352	AAG	2	6	10071	10076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_007352	A	6	6	10085	10090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007352	CGA	2	6	10091	10096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_007352	T	7	7	10164	10170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_007352	TA	3	6	10181	10186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_007352	AGG	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_007352	A	6	6	11255	11260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_007352	TCTT	2	8	16833	16840	0 %	75 %	0 %	25 %	73663820
419	NC_007352	ATC	2	6	16850	16855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_007352	ATTT	2	8	16872	16879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_007352	TAT	2	6	16885	16890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_007352	GCAA	2	8	16911	16918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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